Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRRTM2O43300 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LRRTM2O43300 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LRRTM2O43300 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LRRTM2O43300 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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LRRTM2O43300 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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