Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP3K13O43283 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms