Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC1O14908 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC1O14908 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms