Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E9PBE3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E9PBE3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E9PBE3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E9PBE3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E9PBE3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E9PBE3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E9PBE3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E9PBE3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
E9PBE3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E9PBE3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms