Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms