Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms