Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms