Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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