Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms