Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms