Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR3

TBX20, T-box transcription factor TBX20, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX20Q9UMR3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TBX20Q9UMR3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TBX20Q9UMR3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms