Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms