Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MARCH4Q9P2E8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms