Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXXC1Q9P0U4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms