Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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