Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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