Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms