Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms