Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms