Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 665.9 ms