Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms