Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms