Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms