Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms