Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms