Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms