Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms