Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms