Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXPE2Q96DL1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms