Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms