Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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