Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms