Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LCN9Q8WX39 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms