Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms