Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP9

ZNF547, Zinc finger protein 547, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF547Q8IVP9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF547Q8IVP9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms