Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms