Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms