Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms