Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms