Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms