Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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