Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms