Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL15Q16663 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL15Q16663 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms