Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ZNF239Q16600 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ZNF239Q16600 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ZNF239Q16600 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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