Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CARTPTQ16568 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms