Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GABRA6Q16445 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GABRA6Q16445 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GABRA6Q16445 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GABRA6Q16445 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GABRA6Q16445 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GABRA6Q16445 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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