Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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