Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms