Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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