Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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PDCD1Q15116 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PDCD1Q15116 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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